Après avoir gouverné ses fils, ses petits-fils et ses arrières-petits-fils, Brunehaut fut livrée par ses propres soldats à Clotaire II, qui mit fin à la guerre entre les deux familles royales de Sigebert 1er et Chilpéric 1er. Avec l’anéantissement de Brunehaut et de toute sa descendance, Clotaire II réunit les Francs en un seul royaume. Il reprocha à Brunehaut la mort de dix rois, l’abandonna trois jours durant aux exactions de son armée puis la fit attacher par les cheveux et une jambe à la queue d’un cheval sauvage. Mutilée par les sabots du cheval, elle finit en lambeaux et désarticulée.
Il s’agissait autant d’une exécution que d’une mise à l’épreuve de la nature royale de Brunehaut. Etant reine, elle avait commandement au nom de Dieu sur la nature et les animaux ; que le cheval n’en tînt pas compte devait prouver à tous que Dieu avait retiré son soutien à la reine, et que le royaume revenait bien à Clotaire II…
Mort épouvantable pour cette reine qui s’était révélée une véritable femme d’Etat, mais extrêmement despotique.